Майкл Джексон не был открытым последователем какой-либо церкви, однако проявлял интерес к религии различных конфессий.

Кэтрин Джексон (мать Майкла) была крещена в 1963 году, когда Майклу было пять лет. Мать пыталась воспитать Майкла как свидетеля Иеговы и побуждала его к изучению Библии, посещению христианских встреч в Залах Царства и проповеди. Однако взаимоотношения его с организацией свидетелей Иеговы не сложились.

К 1984 году, несмотря на его огромную известность, Майкл Джексон продолжал проповедовать как свидетель Иеговы, два раза в неделю, может быть, час или два. Он также присутствовал на христианских встречах в Зале Царства с матерью четыре раза в неделю, когда бывал в городе. Он отказывался от употребления в пищу крови, празднования Пасхи и Рождества, которые он рассматривал как «языческие праздники», от празднования собственного дня рождения.

Тем не менее, в 1987-м году, Джексон покидает организацию свидетелей Иеговы в ответ на неодобрительные отзывы о видеофильме «Триллер». Этому, в частности, поспособствовало то, что сестра Майкла Ла Тойя Джексон была исключена из организации примерно в это же время. Майклу, как и всем остальным членам организации, было запрещено общаться с ней на духовные темы (на бытовые темы в вынужденной ситуации общаться можно), что стало для него ударом. Майкл нарушил этот принцип и в результате сам перестал посещать встречи свидетелей Иеговы. В 1987 году было объявлено, что Майкл Джексон больше не является свидетелем Иеговы.

Брат Майкла, Джермен Джексон, открыто исповедует ислам, и часто дарил брату книги об этой религии. Джермен надеялся, что увлечение религией защитит Майкла от нервных расстройств и дурных привычек.

21 ноября 2008 года таблоид The Sun сообщил, что Джексон на церемонии шахады, «свидетельство, что нет Бога кроме Аллаха и Мухамад его посланник» якобы сменил имя на Микаэль в знак принятия ислама, когда был в Лос-Анджелесе у композитора Стива Поркаро. Эта информация никогда не была подтверждена самим Джексоном. Адвокат Джексона Лонделл Макмиллан опроверг это сообщение, сказав про него, что «это ерунда. Это полная неправда».

Джексон также был близко знаком с Андре Краучем, христианским музыкантом и исполнителем госпела. Незадолго до смерти певец посетил вместе с Краучем христианскую церковь и исполнил несколько христианских песен. По словам Крауча и его сестры, Джексон расспрашивал об их обычаях, но ничего не говорил о желании присоединиться к их деноминации